Het is nog onbekend hoeveel het Kwaliteitsinstituut gaat kosten. Het instituut is niet opgenomen op de begroting, zo meldt Zorgvisie.
Uit hetzelfde bericht is op te maken dat het Kwaliteitsinstituut betaald moet worden uit de middelen van het College voor zorgverzekeringen (CVZ). Het Kwaliteitsinstituut zal daar worden ondergebracht. Dat betekent wel dat de werkzaamheden van het CVZ worden uitgebreid. Het college gaat er dan ook van uit in de toekomst over een grotere zak geld te kunnen beschikken. Dit jaar krijgt het CVZ 41 miljoen euro.
2013 operationieel
Het Kwaliteitsinstituut moet vanaf 2013 operationeel zijn. In 2012 wordt het instituut opgestart. Volgens Pieter Vierhout, die als voorzitter van de Regieraad kwaliteit van zorg nauw bij het op te richten Kwaliteitsinstituut betrokken is, vindt het niet vreemd dat er nu nog niets over de financiering bekend is. Het Kwaliteitsinstituut zal volgens hem niet meer kosten dan de instituties die het vervangt, zoals Zichtbare Zorg en de Regieraad.