Ate van der Zee is sinds 1 november 2019 voorzitter van de raad van bestuur van het UMCG. Hij is tevens voorzitter van het Regionaal Overleg Acute Zorg (ROAZ) Noord-Nederland.
Van der Zee trad in januari 2013 toe tot de raad van bestuur van het UMCG. In 2016 werd hij benoemd tot vicevoorzitter. Hij is sinds 1995 als gynaecoloog-oncoloog verbonden aan het UMCG, waar hij in 2000 werd benoemd tot hoogleraar Gynaecologische Oncologie. Tot december 2012 was hij hoofd van de afdeling Obstetrie en Gynaecologie en tevens hoofd van de sectie Gynaecologische Oncologie.