Hans van Goudoever is voorzitter van de raad van bestuur van Amsterdam UMC en decaan van de Faculteit Geneeskunde van de UvA.
In 2004 werd hij hoofd van de afdeling Neonatologie in het Sophia Kinderziekenhuis. In 2010 kwam hij naar Amsterdam, waar hij hoofd werd van de afdeling Kindergeneeskunde van zowel VUmc als AMC. Sinds 2012 is hij voorzitter van de divisie Vrouw-Kind op beide locaties, ruim voordat de bestuurlijke fusie van Amsterdam UMC in 2018 een feit was.
Vanuit zijn klinische ervaring was Van Goudoever oprichter van de Nationale Moedermelkbank, waarmee hij heeft bijgedragen aan de gezondheid van te vroeg geboren baby’s en het welbevinden van hun moeders.
Van Goudoever is lid van de Gezondheidsraad, toezichthouder bij Omega, toezichthouder bij Kenniscentrum Kinderpalliatieve Zorg en voorzitter bij Stichting Kinder Oncologie Centrum Amsterdam SKOCA.