Henk Snapper is per 15 januari 2024 voorzitter van de raad van bestuur van het Martini Ziekenhuis in Groningen.
In 2023 was hij lid raad van bestuur van het Amsterdam UMC.
Tot 1 januari 2023 was hij vicevoorzitter van de raad van bestuur met de portefeuille bedrijfsvoering en innovatie bij UMCG.