Wim Kuijken is voorzitter van de raad van toezicht van het Amsterdam UMC (AMC en VUmc).
Kuijken is verder President-Commissaris van De Nederlandsche Bank NV, voorzitter van de Raad van Toezicht van de Luchtverkeersleiding Nederland, voorzitter van de Raad van Toezicht van het Kadaster, voorzitter van de Raad van Toezicht van de “The Hague Security Delta”, een samenwerkingsverband van bedrijfsleven, kennisinstellingen en overheid op het gebied van digitale veiligheid. Hij is lid van de adviesraad van het NWO-instituut ASTRON en van het Nationaal Park “De Hoge Veluwe”. Kuijken is tevens decaan van een Leernetwerk en mentor bij de Nederlandse School voor het Openbaar Bestuur (NSOB).